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. 1995 May;6(3):141-4.
doi: 10.1155/1995/187049.

Epidemiological typing of Moraxella catarrhalis by pulsed field gel electrophoresis

S M Davison  1 , D E Low, R H Cruz, D Beaulieu, S R Scriver
Affiliations

Epidemiological typing of Moraxella catarrhalis by pulsed field gel electrophoresis

S M Davison et al. Can J Infect Dis. 1995 May.

Abstract
in English, French

Pulsed field gel electrophoresis (pfge) was used to compare 59 strains of Moraxella catarrhalis to evaluate pfge for the epidemiological typing of this organism. pfge-generated patterns were compared with those obtained by small fragment restriction enzyme analysis (rea) and species-specific probe hybridization. The strains used in the study were isolated from various geographic locations and included proven epidemiologically related strains. pfge yielded more unique patterns than dna-dna hybridization - 30 versus 18, respectively - but fewer than rea, which generated 45 unique patterns. Strains that demonstrated the same rea pattern or dna-dna hybridization pattern did not always demonstrate the same pfge pattern. For example, in 23 epidemiologically unrelated strains that shared six rea patterns, pfge differentiated the isolates into 12 patterns. Conversely, strains that demonstrated the same pfge pattern did not always demonstrate the same rea pattern or hybridization pattern. For example, in 42 strains that shared 13 pfge patterns, rea differentiated the isolates into 31 patterns and dna-dna hybridization differentiated them into 16 patterns. However, compared with rea, pfge yielded less complex patterns that were more easily comparable, and compared with dna-dna hybridization, pfge was technically easier.

L’électrophorèse en champ pulsé (ecp) a été utilisée afin de comparer 59 souches de Moraxella catarrhalis en vue de déterminer si l’ecp pouvait être utilisée pour le typage épidémiologique de cet organisme pathogène. Les modèles générés par ecp ont été comparés à ceux qu’avaient donné une analyse des enzymes de restriction de petits fragments (aer) et une hybridation par sonde spécifique à l’espèce. Les souches utilisées dans l’étude ont été isolées à partir de différents sites géographiques et comprenaient des souches épidémiologiquement apparentées. L’ecp a généré des modèles plus uniques que l’hybridation dna-dna, soit 30 contre 18, respectivement, mais moins que l’aer, qui a généré 45 modèles uniques. Les souches dont le modèle était semblable à l’aer ne se sont pas toujours exprimé semblablement à l’ecp. Par exemple, des 23 souches indépendantes sur le plan épidémiologique manifestant six modèles différents à l’aer, l’ecp a plutôt identifié 12 modèles. En revanche, les souches qui démontraient le même modèle à l’ecp n’ont pas toujours donné les mêmes résultats à l’aer ou à l’hybridation. Par exemple, des 42 souches qui se part-ageaient 13 modèles à l’ecp, l’aer a différencié les isolats entre 31 modèles, et l’hybridation dna-dna les a différenciés en 16 modèles. Toutefois, en comparaison avec l’aer, l’ecp a généré des modèles moins complexes, qui étaient plus facilement comparables et en comparaison à l’hybridation, elle s’est révélée plus facile réaliser sur le plan technique.

Keywords: Gene probing; Moraxella catarrhalis; Pulsed field gel electrophoresis; Restriction enzyme analysis.

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Figures

Figure 1)
Figure 1)
Pulsed field gel electrophoresis of SmaI cleaved genomic DNA of eight epidemiologically unrelated strains of Moraxella catarrhalis from diverse geographical areas including Sweden, Great Britain, Texas and five Canadian provinces. Lane 9 shows lambda ladder pulsed field gel molecular size marker
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References

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