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. 2014 Sep 21;4(3):179-83.
doi: 10.5588/pha.14.0025.

Evaluation of the implementation of the Xpert® MTB/RIF assay in Fiji

A Gounder  1 , S Gounder  1 , S A Reid  2
Affiliations

Evaluation of the implementation of the Xpert® MTB/RIF assay in Fiji

A Gounder et al. Public Health Action. .

Abstract
in English, French, Spanish

Setting: All Xpert® MTB/RIF tests performed in the three TB (tuberculosis) treatment centres in Fiji from June 2012 to February 2013.

Objectives: To determine 1) the number of Xpert tests performed in each centre, 2) the association between sputum quality and Xpert results, 3) the agreement of Xpert with acid-fast bacilli (AFB) smear microscopy and TB culture and 4) error rates.

Design: Retrospective review of records.

Results: A total of 415 Xpert tests were performed in the study period. Mycobacterium tuberculosis was detected in 69 (16.6%) samples. No rifampicin resistance was detected. M. tuberculosis was detected from 60 (18.7%) good-quality sputum samples. A total of 43 (10.4%) errors occurred during this period. M. tuberculosis was detected in 10 (2.9%) smear-negative specimens. There was a substantial and an almost perfect agreement between Xpert and AFB microscopy (κ = 0.793) and culture results (κ = 0.818), respectively.

Conclusion: Although a good correlation between Xpert and the two tests were shown in the study, Xpert should not replace the routine first-line TB diagnostic tests used in Fiji for reasons related to logistics and sustainability. A further evaluation of the assay's performance is required over a longer time period to gauge its diagnostic value in detecting smear-negative, Xpert-positive cases in Fiji.

Contexte : Tous les tests Xpert® MTB/RIF réalisés dans les trois centres de traitement anti-tuberculeux aux Fidji entre juin 2012 et février 2013.Objectifs : Déterminer 1) le nombre de tests Xpert réalisés dans chaque centre, 2) l'association entre la qualité des crachats et le résultat du test Xpert, 3) l'accord entre Xpert et la microscopie des crachats acido alcoolo résistant (AFB) et la culture, et 4) le taux d'erreurs.Schéma : Revue rétrosp ective de dossiers.Résultats : Un total de 415 tests Xpert a été réalisé pendant la période d'étude. Mycobacterium tuberculosis a été détecté dans 69 (16.6%) échantillons. Aucune résistance à la rifampicine n'a été décelée. M. tuberculosis a été identifié dans 60 (18,7%) échantillons de crachats de bonne qualité. Un total de 43 (10,4%) erreurs sont survenues pendant la période d'étude. M. tuberculosis a été identifié dans 10 (2,9%) spécimens à frottis négatif. Il y a eu une concordance substantielle et presque parfaite entre les résultats du Xpert et ceux de la microscopie AFB (κ = 0,793) et de la culture (κ = 0,818), respectivement.Conclusion : En dépit de la bonne corrélation entre Xpert et les deux autres tests mise en évidence dans l'étude, Xpert ne peut toujours pas remplacer les tests de diagnostic de routine utilisés en première intention aux Fidji, en raison de contraintes logistiques et de problèmes de pérennité. Il est nécessaire de réaliser une évaluation ultérieure de la performance de ce test sur une période plus longue afin de mesurer sa valeur diagnostique dans la détection de cas à frottis négatif, Xpert positif aux Fidji.

Marco de referencia: Todas las pruebas Xpert® MTB/RIF realizadas en los tres centros de atención de la tuberculosis (TB) de Fiji entre junio del 2012 y febrero del 2013.Objetivos: Obtener la siguiente información: 1) el número de pruebas Xpert realizadas en cada centro; 2) la asociación entre la calidad de la muestra de esputo y el resultado de la prueba Xpert; 3) la concordancia de los resultados de esta prueba con la baciloscopia y el cultivo para Mycobacterium tuberculosis; y 4) las tasas de error de la prueba.Método: Fue este un estudio retrospectivo a partir de las historias clínicas.Resultados: Durante el período del estudio se practicaron 415 pruebas Xpert. Esta prueba aportó un resultado positivo para M. tuberculosis en 69 muestras de esputo (16,6%). No se encontró resistencia a rifampicina. Se detectó M. tuberculosis en 60 de muestras de esputo de buena calidad (18,7%). Se registraron 43 resultados de error de la prueba durante el período estudiado (10,4%). La prueba detectó M. tuberculosis en 10 muestras con baciloscopia negativa (2,9%). La concordancia de los resultados de la prueba Xpert con la baciloscopia del esputo fue notable (κ = 0,793) y casi perfecta con los resultados del cultivo (κ = 0,818).Conclusión: Si bien en el presente estudio la prueba Xpert exhibió una buena correlación con los métodos de referencia, todavía no puede remplazar las pruebas sistemáticas de elección en el diagnóstico de la TB en Fiji por razones operativas y de sostenibilidad. Es necesario realizar nuevos estudios de rendimiento diagnóstico durante un período más prolongado, a fin de estimar su utilidad diagnóstica en los casos que presentan una baciloscopia negativa y una prueba Xpert positiva en Fiji.

Keywords: Mycobacterium tuberculosis; Xpert® MTB/RIF; evaluation; rifampicin.

PubMed Disclaimer

References

    1. Arzu N Z, Sezai T, Cengiz C. Evaluation of the GeneXpert® MTB/RIF assay for rapid diagnosis of tuberculosis and detection of rifampin resistance in pulmonary and extrapulmonary specimens. J Clin Microbiol. 2011;49:4138–4141. - PMC - PubMed
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