[Getting an insight into the brain - new optical clearing techniques and imaging using light-sheet microscope]
- PMID: 28409571
[Getting an insight into the brain - new optical clearing techniques and imaging using light-sheet microscope]
Abstract
One of the biggest challenges in neuroscience is to understand how brain operates. For this, it would be the best to image the whole brain with at least cellular resolution, preserving the three-dimensional structure in order to capture the connections between different areas. Most currently available high-resolution imaging techniques are based on preparing thin brain sections that are next photographed one by one and subsequently bigger structures are reconstructed. These techniques are laborious and create artifacts. Recent optical clearing methods allow to obtain literally transparent brains that can be imaged using light-sheet microscope. The present review summarizes the most popular optical clearing techniques, describing their different mechanisms and comparing advantages and disadvantages of different approaches, and presents the principle of light-sheet microscopy and its use in imaging. Finally, it gives examples of application of optical tissue clearing and light-sheet imaging in neuroscience and beyond it.
Zrozumienie działania mózgu jest jednym z największych wyzwań współczesnej neurobiologii. W osiągnięciu tego celu bardzo pomogłaby metoda obrazowania całego mózgu z przynajmniej komórkową rozdzielczością, jednocześnie zachowująca jego trójwymiarową strukturę i połączenia pomiędzy poszczególnymi obszarami. Większość dostępnych obecnie wysokorozdzielczych technik obrazowania polega na obrazowaniu cienkich skrawków jeden po drugim i rekonstrukcji obrazu większych obszarów. To podejście jest jednak pracochłonne i obarczone błędami. Opracowane ostatnio metody optycznego oczyszczania tkanki pozwalają otrzymać przezroczyste mózgi, które mogą być obrazowane w całości przy pomocy mikroskopu opartego na arkuszu światła. W niniejszej pracy omówione są najpopularniejsze metody oczyszczania optycznego z uwzględnieniem ich mechanizmu działania oraz mocnych i słabych stron. Opisujemy również mikroskopię opartą na arkuszu światła i jej zastosowanie w obrazowaniu całego mózgu. Na koniec podajemy przykłady opisanych w literaturze doświadczeń z neurobiologii i innych dziedzin, w których wykorzystano metody oczyszczania tkanek i mikroskopię opartą na arkuszu światła.
Keywords: light-sheet microscopy; optical clearing; whole-brain imaging.
Similar articles
-
Whole-Brain Single-Cell Imaging and Analysis of Intact Neonatal Mouse Brains Using MRI, Tissue Clearing, and Light-Sheet Microscopy.J Vis Exp. 2022 Aug 1;(186):10.3791/64096. doi: 10.3791/64096. J Vis Exp. 2022. PMID: 35969091 Free PMC article.
-
Optical Clearing and Labeling for Light-sheet Fluorescence Microscopy in Large-scale Human Brain Imaging.J Vis Exp. 2024 Jan 26;(203). doi: 10.3791/65960. J Vis Exp. 2024. PMID: 38345230
-
Whole-Brain Microscopy Meets In Vivo Neuroimaging: Techniques, Benefits, and Limitations.Mol Imaging Biol. 2017 Feb;19(1):1-9. doi: 10.1007/s11307-016-0988-z. Mol Imaging Biol. 2017. PMID: 27590493 Review.
-
Light sheet fluorescence microscopy for neuroscience.J Neurosci Methods. 2019 May 1;319:16-27. doi: 10.1016/j.jneumeth.2018.07.011. Epub 2018 Jul 23. J Neurosci Methods. 2019. PMID: 30048674 Review.
-
Expansion Light Sheet Microscopy Resolves Subcellular Structures in Large Portions of the Songbird Brain.Front Neuroanat. 2019 Jan 31;13:2. doi: 10.3389/fnana.2019.00002. eCollection 2019. Front Neuroanat. 2019. PMID: 30766480 Free PMC article.