Nasal Swab Sampling for SARS-CoV-2: a Convenient Alternative in Times of Nasopharyngeal Swab Shortage

Hélène Péré^{1

2

3}, Isabelle Podglajen^{3

4}, Maxime Wack^{5

6}, Edouard Flamarion⁷, Tristan Mirault^{2

8}, Guillaume Goudot^{2

8}, Caroline Hauw-Berlemont⁹, Laetitia Le^{10

11}, Eric Caudron^{10

11}, Sophie Carrabin⁷, Julien Rodary¹, Tatiana Ribeyre¹, Laurent Bélec^{1

3

4}, David Veyer^{12

3

13}

Affiliations

¹ Laboratoire de Virologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
² INSERM U970, PARCC, Hôpital Européen Georges Pompidou, Faculté de Médecine, Université de Paris, Paris, France.
³ Service de Microbiologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
⁴ Faculté de Médecine Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Université de Paris, Paris, France.
⁵ Département d'Informatique Médicale, Biostatistiques et Santé Publique, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
⁶ Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, UMRS 1138, Université de Paris, Paris, France.
⁷ Département de Médecine Interne, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
⁸ Départment de Médecine Vasculaire, HYPERVASC, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
⁹ Service de Médecine Intensive-Réanimation, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
¹⁰ Laboratoire de Chimie Analytique Pharmaceutique, EA7357, Université Paris Sud-Paris-Saclay, Châtenay-Malabry, France.
¹¹ Départment de Pharmacie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
¹² Laboratoire de Virologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France david.veyer@aphp.fr.
¹³ Unité de Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, Université de Paris, Paris, France.

PMID: 32295896
PMCID: PMC7269411
DOI: 10.1128/JCM.00721-20

Nasal Swab Sampling for SARS-CoV-2: a Convenient Alternative in Times of Nasopharyngeal Swab Shortage

Hélène Péré et al. J Clin Microbiol. 2020.

. 2020 May 26;58(6):e00721-20.

doi: 10.1128/JCM.00721-20. Print 2020 May 26.

Authors

Affiliations

¹ Laboratoire de Virologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
² INSERM U970, PARCC, Hôpital Européen Georges Pompidou, Faculté de Médecine, Université de Paris, Paris, France.
³ Service de Microbiologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
⁴ Faculté de Médecine Paris Descartes, Sorbonne Paris Cité, Université de Paris, Paris, France.
⁵ Département d'Informatique Médicale, Biostatistiques et Santé Publique, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
⁶ Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, UMRS 1138, Université de Paris, Paris, France.
⁷ Département de Médecine Interne, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
⁸ Départment de Médecine Vasculaire, HYPERVASC, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
⁹ Service de Médecine Intensive-Réanimation, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
¹⁰ Laboratoire de Chimie Analytique Pharmaceutique, EA7357, Université Paris Sud-Paris-Saclay, Châtenay-Malabry, France.
¹¹ Départment de Pharmacie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France.
¹² Laboratoire de Virologie, Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, Paris, France david.veyer@aphp.fr.
¹³ Unité de Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides, Centre de Recherche des Cordeliers, INSERM, Université de Paris, Paris, France.

PMID: 32295896
PMCID: PMC7269411
DOI: 10.1128/JCM.00721-20

No abstract available

Keywords: COVID-19; RT-PCR; SARS-CoV-2; molecular diagnosis; nasal swab; nasopharyngeal swab.

PubMed Disclaimer

References

1. World Health Organization. 19 March 2020. Laboratory testing for 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) in suspected human cases. Interim guidance. WHO/COVID-19/laboratory/2020.5. World Health Organization, Geneva, Switzerland. https://www.who.int/publications-detail/laboratory-testing-for-2019-nove.... Accessed 27 March 2020.
1. Lambert SB, Whiley DM, O’Neill NT, Andrews EC, Canavan FM, Bletchly C, Siebert DJ, Sloots TP, Nissen MD. 2008. Comparing nose-throat swabs and nasopharyngeal aspirates collected from children with symptoms for respiratory virus identification using real-time polymerase chain reaction. Pediatrics 122:e615–e620. doi:10.1542/peds.2008-0691. - DOI - PubMed
1. Meerhoff TJ, Houben ML, Coenjaerts FE, Kimpen JL, Hofland RW, Schellevis F, Bont LJ. 2010. Detection of multiple respiratory pathogens during primary respiratory infection: nasal swab versus nasopharyngeal aspirate using real-time polymerase chain reaction. Eur J Clin Microbiol Infect Dis 29:365–371. doi:10.1007/s10096-009-0865-7. - DOI - PMC - PubMed

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