Skip to main page content
U.S. flag

An official website of the United States government

Dot gov

The .gov means it’s official.
Federal government websites often end in .gov or .mil. Before sharing sensitive information, make sure you’re on a federal government site.

Https

The site is secure.
The https:// ensures that you are connecting to the official website and that any information you provide is encrypted and transmitted securely.

Access keys NCBI Homepage MyNCBI Homepage Main Content Main Navigation
. 2020 Aug:46 Suppl 1:6-11.
doi: 10.1016/j.semerg.2020.06.010. Epub 2020 Jun 23.

Predictive factors of COVID-19 in patients with negative RT-qPCR

J López de la Iglesia  1 , T Fernández-Villa  2 , A Rivero  3 , A Carvajal  4 , E Bay Simon  5 , M Martínez Martínez  6 , H Argüello  4 , H Puente  4 , J P Fernández Vázquez  7
Affiliations

Predictive factors of COVID-19 in patients with negative RT-qPCR

J López de la Iglesia et al. Semergen. 2020 Aug.

Abstract
in English, Spanish

Objective: To evaluate the factors associated with false negatives in RT-qPCR in patients with mild-moderate symptoms of COVID-19.

Materials and methods: This was a cross-sectional study that used a random sample of non-hospitalized patients from the primary care management division of the Healthcare Area of Leon (58 RT-qPCR-positive cases and 52 RT-qPCR-negative cases). Information regarding symptoms was collected and all patients were simultaneously tested using two rapid diagnostic tests - RDTs (Combined - cRDT and Differentiated - dRDT). The association between symptoms and SARS-CoV-2 infection was evaluated by non-conditional logistic regression, with estimation of Odds Ratio.

Results: A total of 110 subjects were studied, 52% of whom were women (mean age: 48.2±11.0 years). There were 42.3% of negative RT-qPCRs that were positive in some RDTs. Fever over 38°C (present in 35.5% of cases) and anosmia (present in 41.8%) were the symptoms most associated with SARS-CoV-2 infection, a relationship that remained statistically significant in patients with negative RT-qPCR and some positive RDT (aOR=6.64; 95%CI=1.33-33.13 and aOR=19.38; 95% CI=3.69-101.89, respectively).

Conclusions: RT-qPCR is the technique of choice in the diagnosis of SARS-CoV-2 infection, but it is not exempt from false negatives. Our results show that patients who present mild or moderate symptoms with negative RT-qPCR, but with fever and/or anosmia, should be considered as suspicious cases and should be evaluated with other diagnostic methods.

Objetivo: Evaluar los factores asociados con falsos negativos a RT-qPCR negativa y sintomatología leve o moderada de COVID-19.

Materiales y métodos: Estudio transversal. Se utilizó una muestra aleatoria de pacientes no hospitalizados de la Gerencia de Atención Primaria del Área de Salud de León (58 con RT-qPCR positiva y 52 con RT-qPCR negativa). Se recogió información sobre síntomas, y a todos se les realizaron simultáneamente dos pruebas de diagnóstico rápido (PDR): combinada (PRD-C) y diferenciada (PRD-D). La asociación de los síntomas con la infección por SARS-CoV-2 se evaluó mediante regresión logística no condicional, con el cálculo de odds ratio (OR).

Resultados: Se estudiaron un total de 110 personas, y el 52% de ellas fueron mujeres (edad media: 48,2 ± 11,0 años). El 42,3% de las RT-qPCR negativas dieron positivo en algún PDR. La fiebre de más de 38 °C (presente en el 35,5% de los casos) y la anosmia (presente en el 41,2%) fueron los síntomas más asociados a la infección por SARS-CoV-2, relación que se mantuvo estadísticamente significativa en pacientes con RT-qPCR negativa y algún PDR positivo (ORa: 6,64; IC 95%: 1,33-33,13, y ORa: 19,38; IC 95%: 3,69-101,89, respectivamente).

Conclusiones: La RT-qPCR es la técnica de elección en el diagnóstico de la infección por SARS-CoV-2, pero no está exenta de falsos negativos. Nuestros resultados ponen de manifiesto que los pacientes que presentan síntomas leves o moderados con RT-qPCR negativa pero con fiebre y/o anosmia deben ser considerados casos sospechosos y deben ser valorados con otros métodos diagnósticos.

Keywords: Anosmia; Diagnosis; Diagnóstico; Fever; Fiebre; RT-qPCR; SARS-CoV-2.

PubMed Disclaimer

Figures

Figure 1
Figure 1
Results obtained in the different diagnostic tests evaluated.
Figure 2
Figure 2
Presence or absence of fever and/or anosmia according to diagnostic test results.
See this image and copyright information in PMC

References

    1. Ministerio de Sanidad. Información científico – técnica. Enfermedad por coronavirus, covid-19. Available from: https://www.mscbs.gob.es/profesionales/saludPublica/ccayes/alertasActual... [accessed 09.05.20].
    1. Li C., Ren L. Recent progress on the diagnosis of 2019 Novel Coronavirus. Transbound Emerg Dis. 2020 doi: 10.1111/tbed.13620. - DOI - PMC - PubMed
    1. Ministerio de ciencia e Innovación. Nanociencia y Nanotecnología (ICN2), CSIC, CIBER-BBN y BIST Bellaterra, Barcelona (España). Técnicas y sistemas de diagnóstico para COVID-19. Available from: https://www.ciencia.gob.es/stfls/MICINN/Ministerio/FICHEROS/TecnicasDiag... [accessed 10.05.20].
    1. Sociedad Española de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clinica. Recomendaciones institucionales. Documento de posicionamiento de la SEIMC sobre el diagnóstico microbiológico del COVID-19. Available from: https://seimc.org/contenidos/documentoscientificos/recomendaciones/seimc... [accessed 17.05.20].
    1. Madrigal-Rojas J.P., Quesada-Loría M., García-Sánchez M., Solano-Chinchilla A. SARS CoV-2, manifestaciones clínicas y consideraciones en el abordaje diagnóstico de COVID-19. Revista Médica de Costa Rica. 2020;85