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. 2015 Jun 26;4(1):168.
doi: 10.4102/ajlm.v4i1.168. eCollection 2015.

Quantification de la Charge Virale et tests de résistance du VIH-1 aux ARV à partir d’échantillons DBS (Dried Blood Spots) chez des patients Guinéens sous traitement antirétroviral

[Article in French]
Nestor Bangoura  1 , Abou A M Diouara  2 , Mohamed Cissé  1 , Halimatou D Ndiaye  2 , Souleymame Mboup  2 , Ahidjo Ayouba  3 , Coumba T Kane  2
Affiliations

Quantification de la Charge Virale et tests de résistance du VIH-1 aux ARV à partir d’échantillons DBS (Dried Blood Spots) chez des patients Guinéens sous traitement antirétroviral

[Article in French]
Nestor Bangoura et al. Afr J Lab Med. .

Abstract
in English, French

Quantification of Viral load and resistance tests of HIV-1 to ARVs from dried blood spots samples in Guinean patients undergoing antiretroviral treatment.

Problem: As in several countries of the South, the virological monitoring of patients undergoing antiretroviral treatment (ARVT) in Guinea is low or non-existent in some locations. The aim of this study was to assess the technical and logistical feasibility of the use of (dried blood spots) DBSs in viral load (VL) and genotyping tests.

Method: From September 2010 to October 2010, DBS were prepared from blood samples of adult patients under ARVT. The samples had to be sent to the reference laboratory within 30 days after the sample had been done at ambient temperature. The VL was quantified and the samples of patients with virological failure (CV ≥ 3 log10 copies/mL) were genotyped according to the ANRS protocol. The Stanford algorithm, version 6.0.8, was used to analyse and interpret the resistance mutations.

Results: Amongst the 136 included patients, 129 and 7 were under first and second line treatment respectively, and monitored for an average of 35 months [IQR: 6-108]. Virological failure was noticed among 33 patients. Among them, 84.8% (n = 28/33) benefited from genotyping. The global resistance rate was 14% (n = 19/136). CRF02_AG was the most prevalent viral subtype (82%; n = 23).

Conclusion: In addition to demonstrating the technical and logistic feasibility of VL and genotyping tests from DBSs, these results show the relevance of their use in the virological monitoring of patients under ARVT. Also, this study made it possible to provide information on virological failure, ARV resistance and the HIV-1 genetic diversity in Guinea.

Problématique: Comme dans plusieurs pays du Sud, le suivi virologique des patients sous traitement antirétroviral (TARV) en Guinée est timide voire inexistant dans certaines localités. Le but de cette étude était d’évaluer la faisabilité technique et logistique de l’utilisation des DBS dans les tests de charge virale (CV) et de génotypage.

Méthode: De septembre à octobre 2010, les DBS ont été préparés à partir de prélèvements sanguins de patients adultes sous TARV. Le délai d’envoi des échantillons au laboratoire de référence était de 30 jours maximum après le prélèvement et se faisait à température ambiante. La CV a été quantifiée et les échantillons de patients en échec virologique (CV ≥ 3 log10 copies/mL) ont été génotypés selon le protocole de l’ANRS. L’algorithme de Stanford version 6.0.8 a été utilisé pour l’analyse et l’interprétation des mutations de résistance.

Résultats: Parmi les 136 patients inclus, 129 et 7 étaient respectivement sous première et deuxième ligne de traitement avec une médiane de suivi de 35 mois [IQR: 6-108]. L’échec virologique a été noté chez 33 patients. Parmi eux, 84.8% (n = 28/33) ont bénéficié d’un génotypage. Le taux de résistance global était de 14% (n = 19/136). Le CRF02_AG était le sous type viral le plus prévalent (82%; n = 23)

Conclusion: En plus de montrer la faisabilité technique et logistique des tests de CV et de génotypage à partir des DBS, ces résultats montrent l’intérêt de leurs utilisations dans le suivi virologique des patients sous TARV. Cette étude a permis également de documenter l’échec virologique, la résistance aux ARV et la diversité génétique du VIH-1 en Guinée.

Mots clés: VIH-1, Résistance aux ARV, DBS (Dried Blood Spots), Guinée Conakry, Génotypage, Charge Virale.

PubMed Disclaimer

Figures

FIGURE 1
FIGURE 1
Répartition des sites de collecte des échantillons.
FIGURE 2
FIGURE 2
Fréquences des mutations observées en fonction de la durée du Traitement.
FIGURE 3
FIGURE 3
Arbre PhyML montrant la relation phylogénétique entre les séquences requêtes (n=28, en traits pointillés) et les références (en traits pleins) dans la région du gène pol (PR+RT) du VIH-1.
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References

    1. UNAIDS . UNAIDS report on the global AIDS epidemic. 2012:pp:1–212 [UNAIDS Global AIDS Report web site]. Disponible sur: http://www.unaids.org/en/media/unaids/contentassets/documents/epidemiolo.... [Consulté le 16 Mai 2013].
    1. CNLS-Guinée . Revue des progrès vers la réalisation des cibles de la déclaration 2011 de l’ONU sur le VIH et le Sida. Rapport narratif. 2014:pp:1–36. http://www.unaids.org/fr/regionscountries/countries/guinea/ [Consulté le 05 Juin 2014].
    1. CNLS-Guinée . Rapport UNGASS 2012 _Guinée. 2012:pp:1-71. [UNAIDS Global AIDS Report web site]. Disponible sur http://www.unaids.org/en/dataanalysis/knowyourresponse/countryprogressre.... [consulté le 26 JUIN 2013]
    1. PNPCSP-IST/SIDA . Normes et protocoles de prise en charge de l’infection par le VIH chez l’adulte et l’enfant en GUINEE. 2012:pp:1–103. [WHO web site]. Disponible sur http://www.who.int/hiv/pub/guidelines/guinea_art.pdf. [Consulté le 26 JUIN 2013]
    1. Kebe K, Ndiaye O, Ndiaye HD, et al. . RNA versus DNA (NucliSENS EasyQ HIV-1 v1.2 versus Amplicor HIV-1 DNA test v1.5) for early diagnosis of HIV-1 infection in infants in Senegal. J Clin Microbiol. 2011. Jul;49(7):2590–2593. 10.1128/JCM.02402-10 - DOI - PMC - PubMed

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