[Perspectives of next generation sequencing in the microbiological evaluation and treatment of dog bites]

Abstract

Az antibiotikum-rezisztencia a modern orvoslás egyre több kihívást adó problémája. A kutyaharapás gyógyításának számos esetben elengedhetetlen része az antibiotikus kezelés. Az eredményes gyógyításhoz minél hamarabb ismerni kellene a kórokozókat és azok antibiotikum-érzékenységét. A jelenlegi módszerekkel - baktériumtenyésztés és antibiogram-készítés - napokba, akár hetekbe telhet, mire lelethez jutunk. A közben alkalmazott empirikus antibiotikum-kezelés újabb rezisztens törzseket szelektálhat ki. Az új generációs genomszekvenálással (NGS), illetve nanopore szekvenálással nyert genomszintű adatok gyors, teljes-körű mikrobiológiai lelet lehetőségét ígérik kutyaharapás esetében is. A harmadik generációs nanopore szekvenálás jövőbe mutató módszernek látszik a humán orvoslásban is a mikrobiológiai leletek elkészítésében.

Keywords: antibiotic resistance; antibiotikum-rezisztencia; dog bite; kutyaharapás; next generation sequencing (NGS); új generációs genomszekvenálás (NGS).